Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20854Q62461 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20854Q62461 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm20854Q62461 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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