Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TrhQ62361 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TrhQ62361 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TrhQ62361 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TrhQ62361 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TrhQ62361 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TrhQ62361 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrhQ62361 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TrhQ62361 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TrhQ62361 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TrhQ62361 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrhQ62361 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TrhQ62361 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TrhQ62361 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TrhQ62361 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TrhQ62361 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms