Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema5aQ62217 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema5aQ62217 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema5aQ62217 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms