Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sin3bQ62141 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3bQ62141 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3bQ62141 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sin3bQ62141 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms