Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Odf1Q61999 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf1Q61999 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms