Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Gli3Q61602 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Gli3Q61602 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30,66■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Gli3Q61602 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Gli3Q61602 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,8 ms