Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc6Q61143 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpc6Q61143 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpc6Q61143 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms