Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JrkQ60976 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrkQ60976 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrkQ60976 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrkQ60976 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrkQ60976 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrkQ60976 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JrkQ60976 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JrkQ60976 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JrkQ60976 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrkQ60976 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrkQ60976 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrkQ60976 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JrkQ60976 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrkQ60976 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JrkQ60976 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JrkQ60976 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrkQ60976 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JrkQ60976 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JrkQ60976 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JrkQ60976 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JrkQ60976 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JrkQ60976 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms