Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbbp7Q60973 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp7Q60973 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp7Q60973 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms