Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf123Q5XPI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rnf123Q5XPI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rnf123Q5XPI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms