Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Q5XFZ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q5XFZ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q5XFZ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms