Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
NacadQ5SWP3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC42.14■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
NacadQ5SWP3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NacadQ5SWP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
NacadQ5SWP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC42■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NacadQ5SWP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
NacadQ5SWP3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms