Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsr1Q5SWD9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsr1Q5SWD9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsr1Q5SWD9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsr1Q5SWD9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms