Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LpoQ5SW46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LpoQ5SW46 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LpoQ5SW46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms