Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Psme4Q5SSW2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Psme4Q5SSW2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Psme4Q5SSW2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Psme4Q5SSW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms