Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sft2d1Q5SSN7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms