Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv2-2Q5R1A4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms