Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm6bQ5NCY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm6bQ5NCY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm6bQ5NCY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm6bQ5NCY0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm6bQ5NCY0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms