Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam183bQ5NC57 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam183bQ5NC57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam183bQ5NC57 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam183bQ5NC57 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms