Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q5EBG8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q5EBG8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q5EBG8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q5EBG8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q5EBG8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q5EBG8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q5EBG8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms