Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn2bQ56A07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn2bQ56A07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scn2bQ56A07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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