Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phactr4Q501J7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phactr4Q501J7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phactr4Q501J7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phactr4Q501J7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms