Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc84Q4VA36 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc84Q4VA36 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc84Q4VA36 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc84Q4VA36 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms