Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srbd1Q497V5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srbd1Q497V5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms