Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga1Q3V3R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga1Q3V3R4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itga1Q3V3R4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga1Q3V3R4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms