Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc51Q3URS9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc51Q3URS9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc51Q3URS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms