Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS2

Lsmem1, Leucine-rich single-pass membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsmem1Q3UQS2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsmem1Q3UQS2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsmem1Q3UQS2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsmem1Q3UQS2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsmem1Q3UQS2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsmem1Q3UQS2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsmem1Q3UQS2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsmem1Q3UQS2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsmem1Q3UQS2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms