Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cobll1Q3UMF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cobll1Q3UMF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cobll1Q3UMF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms