Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E330014E10RikQ3UL33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330014E10RikQ3UL33 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms