Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp19Q3UJD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp19Q3UJD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp19Q3UJD6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp19Q3UJD6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms