Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Greb1Q3UHK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Greb1Q3UHK3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Greb1Q3UHK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms