Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LchnQ3UHG7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LchnQ3UHG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms