Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Vars2Q3U2A8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vars2Q3U2A8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vars2Q3U2A8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vars2Q3U2A8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vars2Q3U2A8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms