Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc38a5Q3U1J0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc38a5Q3U1J0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc38a5Q3U1J0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms