Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
H2afvQ3THW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2afvQ3THW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afvQ3THW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms