Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stt3bQ3TDQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stt3bQ3TDQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stt3bQ3TDQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stt3bQ3TDQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms