Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDN2

Faf2, FAS-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf2Q3TDN2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Faf2Q3TDN2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Faf2Q3TDN2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Faf2Q3TDN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms