Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Colec11Q3SXB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Colec11Q3SXB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms