Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chrna5Q2MKA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chrna5Q2MKA5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chrna5Q2MKA5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Chrna5Q2MKA5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Chrna5Q2MKA5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms