Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn2bQ0KL01 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubxn2bQ0KL01 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms