Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700061G19RikQ08EE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700061G19RikQ08EE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms