Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SctQ08535 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SctQ08535 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SctQ08535 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SctQ08535 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SctQ08535 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SctQ08535 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SctQ08535 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SctQ08535 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SctQ08535 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SctQ08535 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SctQ08535 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SctQ08535 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SctQ08535 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SctQ08535 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SctQ08535 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SctQ08535 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SctQ08535 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SctQ08535 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SctQ08535 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SctQ08535 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SctQ08535 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SctQ08535 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SctQ08535 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SctQ08535 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SctQ08535 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SctQ08535 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SctQ08535 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SctQ08535 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SctQ08535 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SctQ08535 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SctQ08535 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SctQ08535 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SctQ08535 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SctQ08535 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SctQ08535 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SctQ08535 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SctQ08535 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SctQ08535 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SctQ08535 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms