Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp2Q06649 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp2Q06649 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms