Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcn1Q05186 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rcn1Q05186 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcn1Q05186 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms