Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sox10Q04888 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox10Q04888 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox10Q04888 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sox10Q04888 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms