Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms