Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk16Q04735 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk16Q04735 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk16Q04735 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms