Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp1Q01514 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp1Q01514 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp1Q01514 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms