Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2cQ01098 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grin2cQ01098 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grin2cQ01098 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grin2cQ01098 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms