Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde1bQ01065 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pde1bQ01065 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms