Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
F8a1Q00558 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
F8a1Q00558 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms